選擇靜電多樣化的單體生成高質量、獲取更好的知識產權
在你的R基團中尋找隱藏的關系,以提高組合庫的多樣性、提高的篩選命中率。
與其他方法不同,PickR使用3D靜電和形狀性質來描述單體之間的分子相似性,從而提供更有意義的化學空間來設計苗頭化合物發現庫。 PickR是與我們的客戶合作開發的,并在藥物化學家和合成化學家中建立了良好的聲譽,它使數據庫的化學多樣性最大化。
計算化學家與化學信息科研人員用PickR可以:
- 根據場和形狀的3D多樣性對試劑庫中的化合物進行排序、挑選。
- 對每一個試劑進行兩兩比對、計算靜電與形狀相似性
- 生成相似性矩陣
- 易于用更多的試劑對現有的庫進行擴增
- 用外部工具自動或手動聚類
- 以2D或3D方式觀察聚類結果
特性
- 靈活的命令行界面
- 支持本地或集群計算
- 支持集群的隊列管理系統
- 自動多步驟計算
- 通過XedEx構象分析工具對2D的SDF或SMILES格式試劑數據庫處理
- 支持3D構象
PickR是一款命令行應用,聯合使用了Cresset與RDKit技術。